FileMon

Win アプリのファイル操作を監視するツール。
ほか数種類のデバッギングツールへのリンクあり。
http://www.sysinternals.com/Utilities/Filemon.html

Process Explorer
http://www.microsoft.com/technet/sysinternals/utilities/ProcessExplorer.mspx
がすばらしい。実行中のプロセスの環境変数、スレッド、ハンドルなどなんでもわかる。